Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ketahanan antar klon kakao terhadap penyakit busuk buah Phytophthora palmivora. Hasil penelitian ini diharapkan dapat bermanfaat bagi usaha untuk menghasilkan bahan tanam yang tahan terhadap penyakit busuk buah, khususnya melalui perbanyakan vegetatif (klonalisasi). Penelitian dilaksanakan dipusat Penelitian Kopi dan Kakao Indonesia, Kaliwining, Jember, Jawa Timur. Penelitian ini menggunakan enam perlakuan yaitu : Jatirono klon 5A, Jatirono klon 5B, Jatirono klon 5P, Kajaran 2, Kali Kempit 2, dan TSH 858. Dalam setiap perlakuan ada 5 buah dan diulang sebanyak 3 kali. Dengan jumlah total buah uji 90. Penelitian ini merupakan percobaan faktor tunggal yang disusun dalam Rancangan Acak Lengkap Completely Randomizet Design (CRD) dengan analisis sidik ragam Analisis of Varian (ANOVA) untuk mengetahui perbedaan atas perlakuan dilakukan uji perlakuan (Statistik) dengan Duncan’s Multiple Range Test (DMRT) dengan jenjang nyata 5%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa klon JTC 5A lebih tahan dan diikuti klon JTC 5B, KJ 2, KPC 2, JTC 5P, dan TSH 858.