Jamur endofit merupakan jamur yang tumbuh dan hidup di dalam jaringan tumbuhan tanpa menyebabkan kerugian pada tumbuhan. Jamur endofit diketahui dapat memberikan keuntungan kepada tumbuhan inangnya seperti meningkatkan ketahanan terhadap serangan penyakit serta dapat memacu pertumbuhan. Jamur endofit dapat ditemukan pada jaringan buah, daun, batang, hingga akar. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi jamur endofit pada akar tanaman karet di KP2 (SEAT) Ungaran. Pengambilan sampel akar tanaman karet di KP2 (SEAT) Ungaran, dilanjutkan tahap isolasi dan identifikasi jamur endofit di Laboratorium Institut Pertanian Stiper Yogyakarta mulai bulan April sampai Juni 2024. Pengambilan sampel menggunakan metode diagonal dan metode identifikasi jamur endofit menggunakan metode deskriptif. Hasil isolasi jamur endofit akar tanaman karet diperoleh 15 isolat jamur. Berdasarkan hasil identifikasi secara makroskopis dan mikroskopis, 13 isolat sudah teridentifikasi. Isolat tersebut terdiri dari 7 genus, di antaranya genus Colletotrichum sp. (B1P5U1 dan B3P2U4), Fusarium sp. (B1P5U2, B1P5U3, B2P2U3 dan B3P3U3), Geotrichum sp. (B2P5U1), Paecilomyces sp. (B3P1U5), Penicillium sp. (B1P1U3, B1P4U5, dan B3P2U2), Rhizoctonia sp. (B2P4U3), Rhizopus sp. (B1P1U4), dan 2 isolat belum diketahui (B2P4U2 dan B2P5U2).