Hydrocyclone merupakan unit pemisahan yang banyak di gunakan pada stasiun Nut dan Kernel di pabrik kelapa sawit untuk memisahkan cangkang dan kernel berdasarkan perbedaan massa jenis dengan memanfaatkan gaya sentrifugal. Penelitian ini bertujuan membandingkan pengaruh modifikasi dimensi hydrocyclone terhadap kernel losses stage 3. Modifikasi dilakukan pada komponen panjang vortex finder dan panjang cone serta body untuk memperbaiki pola aliran dan meningkatkan efektivitas pemisahan kernel dan cangkang. Metode penelitian meliputi pengambilan sampel kernel dan cangkang setiap 2 jam, analisis kernel losses berdasarkan standar pabrik, serta analisis statistik deskriptif dan inferensial menggunakan Uji Wilcoxon Signed Rank Test. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata kernel losses menurun dari 3,50% sebelum modifikasi menjadi 1,20% setelah modifikasi. Dengan standar deviasi 0,25, dan total losses dari 9,95% menjadi 7,46%, standar deviasi 0,78. Selain itu, hasil uji Wilcoxon kernel losses dan total losses menunjukkan perbedaan yang signifikan antara kondisi sebelum dan sesudah modifikasi (p < 0,05).