Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh intensitas penggenangan air dan kematangan pupuk kandang terhadap pertumbuhan padi dan emisi gas CH₄. Penelitian ini dilakukan pada April – Agustus 2024 di KP2 INSTIPER Jl. Nangka II, Krodan, Maguwoharjo, Kecamatan Depok, Kabupaten Sleman, Yogyakarta. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Kelompok (RAK) faktorial dengan dua faktor perlakuan. Faktor pertama adalah intensitas penggenangan air: tergenang terus-menerus dan setengah tergenang. Faktor kedua adalah kematangan pupuk kandang: tanpa pupuk kandang, pupuk kandang segar, pupuk kandang matang, masing-masing kombinasi diulang sebanyak 3 kali. Parameter yang diamati meliputi tinggi tanaman, jumlah anakan produktif, Panjang daun, lebar daun, jumlah daun, Eh potential redoks, suhu tanah, pH tanah, dan emisi gas CH₄. Data hasil penelitian dianalisis menggunakan sidik ragam (Anova) pada jenjang nyata 5%, dan jika terdapat perbedaan nyata dilakukan uji DMRT pada jenjang 5%. Hasil penelitian menunjukkan Kombinasi pupuk matang pada kondisi tergenang terus-menerus (B2G1) menunjukkan kontribusi emisi CH₄ tertinggi selama periode pengamatan, dengan nilai rata-rata berkisar antara 1,5 hingga 2,5 mg m⁻² hari⁻¹. Sebaliknya, kombinasi aplikasi pupuk matang dan setengah tergenang (B2G2) mampu menekan pelepasan gas metana secara nyata, di mana emisi tercatat pada kisaran 0,5–1,0 mg m⁻² hari⁻¹ pada kondisi tergenang dan berada di bawah 0,5 mg m⁻² hari⁻¹ pada kondisi tidak tergenang.